1. Глава Администрации города Апатиты непосредственно координирует и контролирует деятельность:

1.1. Должностных лиц: 
– первого заместителя Главы Администрации города Апатиты; 
– заместителя Главы Администрации города Апатиты;
– заместителя Главы Администрации города Апатиты по правовым вопросам.

1.2. Структурных подразделений: 
– Управления делами Администрации города Апатиты в составе:
– военно-учетного стола Управления делами Администрации города Апатиты;
– ведущего специалиста - ответственного секретаря административной комиссии Управления делами Администрации города Апатиты;
– ведущего специалиста - ответственного секретаря комиссии по делам несовершеннолетних Управления делами Администрации города Апатиты;
– Управления финансов Администрации города Апатиты Мурманской области (с правом юридического лица) в составе:
– отдела бюджетного планирования и экономического анализа Управления финансов Администрации города Апатиты Мурманской области;
– отдела учета, отчетности и контроля бюджетных средств Управления финансов Администрации города Апатиты Мурманской области;
– отдела по мобилизационной работе Администрации города Апатиты.

2. Первый заместитель Главы Администрации города Апатиты непосредственно координирует и контролирует деятельность:
– Комитета по управлению имуществом Администрации города Апатиты Мурманской области (с правом юридического лица); 
– Управления коммунальной инфраструктуры и муниципального жилищного контроля Администрации города Апатиты Мурманской области (с правом юридического лица) в составе:
– сектора муниципального жилищного контроля Управления коммунальной инфраструктуры и муниципального жилищного контроля Администрации города Апатиты Мурманской области;
– управления муниципальных закупок Администрации города Апатиты;
– отдела архитектуры и градостроительства Администрации города Апатиты.

3. Заместитель Главы Администрации города Апатиты непосредственно координирует и контролирует деятельность: 
– Управления образования Администрации города Апатиты Мурманской области (с правом юридического лица) в составе:
– отдела по опеке и попечительству Управления образования Администрации города Апатиты Мурманской области;
– Комитета по физической культуре и спорту Администрации города Апатиты Мурманской области (с правом юридического лица);
– Отдела по культуре и делам молодежи Администрации города Апатиты Мурманской области (с правом юридического лица);
– отдела экономического развития Администрации города Апатиты в составе:
– сектора развития предпринимательства отдела экономического развития Администрации города Апатиты.

4. Заместитель Главы Администрации города Апатиты по правовым вопросам непосредственно координирует и контролирует деятельность:  
– правового управления Администрации города Апатиты;
– отдела организационной работы и кадров Администрации города Апатиты;
– отдела ЗАГС Администрации города Апатиты Мурманской области;
– отдела по опеке и попечительству в отношении совершеннолетних граждан Администрации города Апатиты Мурманской области.

Всего в структуре Администрации города Апатиты по состоянию на 01.01.2020:
– структурных подразделений с правом юридического лица – 6 ед.;
– структурных подразделений без права юридического лица – 15 ед.