Город Апатиты является научным центром Кольского полуострова. Здесь осуществляют деятельность 10 организаций Федерального исследовательского центра «Кольский научный центр Российской академии наук»:
- Геологический институт
- Горный институт
- Институт химии и технологии редких элементов и минерального сырья им. И.В. Тананаева
- Институт экономических проблем имени Г.П. Лузина
- Институт информатики и математического моделирования
- Институт проблем промышленной экологии Севера
- Центр физико-технических проблем энергетики Севера
- Центр наноматериаловедения
- Центр медико-биологических проблем адаптации человека на Севере
- Центр гуманитарных проблем Баренц-региона
При Центре гуманитарных проблем Баренц-региона открыт Музей истории и освоения Европейского Севера.
Подробная информация на сайте ФИЦ КНЦ РАН – https://www.ksc.ru/.
Кроме того, в Апатитах расположены иные научные и научно-прикладные организации:
- Кольский филиал Федерального государственного бюджетного учреждения науки Федерального исследовательского центра «Единая геофизическая служба Российской академии наук»
- Федеральное государственное бюджетное научное учреждение «Полярный геофизический институт»
- подразделения Полярно-альпийского ботанического сада-института КНЦ РАН
- Полярная опытная станция - филиал Федерального исследовательского центра Всероссийский институт генетических ресурсов растений имени Н.И. Вавилова.
- АО «Мурманская геологоразведочная экспедиция»
- ОАО «Кольский геолого-информационный лабораторный центр».